如摘要所述，关于金庸武侠的三个版本，本站就按照旧版、三联版、新修版这样的统一说法。下面就盘点一下《碧血剑》各版本的改动明细。
首出场角色
旧版《碧血剑》中，卷首出场的是明末公子侯朝宗，也称侯方域，是《桃花扇》传奇中的明末四大公子之一。
三联版和新修版中改为渤泥国儒生张朝唐，改由原籍海外的张朝唐当作全书的引子，可以成为最后劝进袁承志到海外开创一番事业的伏笔。
新修版《碧血剑》中，新增一段十六字诀来绑住袁承志，便是：「不降鞑子，不投朝廷，不跟闯王，不害良民。」如此一来，中土既已无容身之处，袁承志只得远渡海外，再也无法影响中原政局。
袁承志
旧版《碧血剑》中，袁承志于泰山被推举为七省武林盟主，该段故事便告结束。
三联版中，为了表现袁承志「为国为民」的情操，盟主接着率领众兄弟，于锦阳关伏击阿巴泰所率领的清军。
新修版中，袁承志的手下进一步成为军队编制，设立「金蛇王营」，后期还增加率军对抗清军的情节，搞了一个崇字营，和清军一场好打。
旧版及三联版《碧血剑》中，袁承志均钟情于青青一人，新修版则改为袁承志亦狂恋阿九。三联版，袁承志潜入皇宫，因情况危急而躲入阿九被中，与她合衾共枕，袁承志将金蛇剑置于两人之间，并声明自己绝非轻薄无礼之人。
在新修版中，袁承志拿开金蛇剑，二人紧紧拥抱，激情热吻，袁承志心中几乎已生「邪念」。袁承志喜欢阿九，但因对青青有约在先，无法处自拔，书中着力描写袁承志对阿九的矛盾心理。青青眼见承志对阿九柔情深重，一怒之下跳崖（未遂），终赢得袁承志之身（心是唤不来的）。
阿九
旧版《碧血剑》中，提到阿九拜木桑道人为师，成为清初女侠，日后甘凤池、白泰官、吕四娘等均出自她门下。《鹿鼎记》中也有韦小宝祝福九难得到「八个威震天下的好徒儿」之语，明显暗示着民间传说的「江南八大侠」。但金庸小说中毕竟从未出现过甘凤池等人物，后面两版便将《碧血剑》中的相关描述删去。
新修版结局时，阿九并未落发为尼，而是随师父去藏边练功，还给了袁承志一个“等你”的盼头。
何铁手
旧版与三联版《碧血剑》中，均有何铁手对女扮男装的青青心生情意，甚且开口示爱的情节。或许金庸觉得这事无关整篇小说，又或许觉得女子爱上女扮男装者太过陈腔滥调，于是删了这段，把何铁手改成了拜师狂魔，第一眼见到袁承志的高超武功便生拜师之念。
新修版《碧血剑》中，苗女何铁手的言语更加无所忌惮。她见袁承志心系阿九，居然鼓励袁承志三妻四妾，一娶青青，二娶阿九，三娶焦宛儿，还告诉师父袁承志，倘使世上无阿九这人，她自己也挺想嫁给他的。
明朝
旧版及三联版《碧血剑》中，图谋崇祯帝位的是诚王，新修版则改为惠王。金庸在注释中说明惠王朱常润于天下大乱时潜归北京之史料，将人物修改得更贴近史实，以增加小说的真实感。
李自成
新修版《碧血剑》中，为更清楚说明李自成兔死狗烹、自毁长城的「杀功臣」事迹，加入一段李自成与「左革五营」内斗，避免功臣觊觎帝位的史料。此段增写李自成杀起义弟兄中的罗汝才、乱世王、革里眼，逼走老回回，天下未定而先内乱。大顺之败，因由不在吴三桂与多尔衮，而是败在大顺的君臣相疑。
石梁派
金庸最初在创作时想起十几年前在石梁读高中的岁月，于是在《碧血剑》中虚构了一个“石梁派”，女主角温青青出生在石梁。在新修版中，石梁派改成了“棋仙派”，其住的地方现在叫静岩。
五毒教
三联版《碧血剑》中，袁承志追查五毒教，先见到黑白蓝黄红五道围墙的无门大宅，其后又见「锦衣毒丐」齐云璈于雪中斗蛇。或因这段情节太过玄异，金庸大笔一改，新修版变成惠王爷以「招贤馆」名义引见，袁承志因而得见五毒教诸人。
清朝
《碧血剑》自旧版修订为三联版的过程中，金庸自言增加了五分之一的篇幅。好比袁承志上盛京行刺皇太极、其后多尔衮暗杀皇太极这个段落，旧版没有，完全是三联版补写的。此段内容增写了皇太极的识见与用人之道，连袁承志都不禁叹服，想来金庸改写时已无满汉狭见，「扬汉抑满」的早期情结已然淡化。
其他角色及大结局
旧版大结局：
1、李岩被闯王所杀，红娘子结局不详；
2、偶遇侯朝宗；
3、借助西洋军官的地图，袁承志自己主观远征异域，海外的地址不详；
4、率领青青、何惕守、哑巴、崔希敏等人，再招集祖仲寿、孟伯飞父子、宛儿夫妇、沙天广、胡桂南等七省豪杰，又得七十二岛岛主郑起云之助，远征异域，终于在海外开辟了一个新天地。
5、以贯休的诗《献钱尚父》其中两句结尾，原句中的“十四州”改为“四十州”。
正是：满堂花醉三千客，一剑霜寒四十州。
三联版大结局：
1、李岩是自杀，红娘子也自杀了；
2、得了张朝唐、杨鹏举等人之助，借助西洋军官的地图，更是张朝唐的建议；
3、远征异域地址明确，实指浡泥国左近，红毛国海盗盘踞的一座大岛屿；
4、率领青青、何惕守、哑巴、崔希敏等人，再召集孙仲寿等“山宗”旧人、孟伯飞父子、罗立如、焦宛儿、程青竹、沙天广、胡桂南、铁罗汉等豪杰，得了张朝唐、杨鹏举等人之助，远征异域，终于在海外开辟了一个新天地。
5、改为查慎行《黔阳元日喜晴》的一句诗结尾：万里霜烟回绿鬓，十年兵甲误苍生。
新修版大结局：
新修版结尾增添许多文字，大体故事细节没写的就是继承了三联版内容（比如李岩和红娘子），主要改动有：
1、这次远征异域，主要是得了洪胜海的渤海派众海盗之助；
2、沙天广，程青竹，崔秋山等豪杰不愿去国远离，便分别觅地占山落草，没有去海外；
3、到海外去，修改成了袁承志实属无奈之举。异域地点不变，与三联版相同，也是浡泥国左近，红毛国海盗盘踞的一座大岛屿。
4、袁承志遥望藏边，心悬阿九，无可奈何下，呼得率同青青，何惕守，罗立如，焦宛儿，安小慧，安大娘，崔希敏等人，及孟伯飞父子、胡桂南、铁罗汉等豪杰，以及愿意随他出海冒险的崇字营从众，上船扬帆出海，得了洪胜海的渤海派众海盗之助，远征异域，终于在海外开辟了一个新天地。
正是：万里霜烟回绿鬓，十年兵甲误苍生。
